微光合細菌的作用非常的強大，它可以凈化魚塘的水質，同時也可以間接的增氧和維持微生態平衡，讓魚有一個良好的生長環境，從而使魚類生長快速，降低飼料系數，提高產量。

　　1、為魚塘凈化水質。許多養魚戶都反映用過光合細菌后魚塘水色好看了。光合細菌能顯著降低魚塘水中的氨氮、硫化氫、亞硝酸鹽，從而凈化水質。光合細菌通過降解有機物糞便、腐敗物來繁殖,并形成有益水體的營養物。

　　2、為魚塘間接增氧。相關研究表明，光合細菌能使魚塘增加20%-30%左右的溶氧。用過光合細菌的各地養殖戶都反映用過后魚不易浮頭，省錢又增產。光合細菌又被稱為“肥水菌”，通過將氨氮、亞硝酸鹽轉化為“肥”——硝酸鹽，穩定水色，藻相好，溶氧就自然充足；同時其通過分解腐敗有機物，減少了池塘晚上耗氧因子。所以，光合細菌自己雖然不直接產生氧氣，但它能間接產生氧氣和減少耗氧因子。

　　3、為魚塘水體維持微生態平衡，預防疾病。魚塘水體中既有有益微生物，又有有害微生物；當有害微生物群體占優勢時，則易導致魚發病。光合細菌可以和致病菌進行抗衡，奪取它的營養和空間，讓病原微生物無法大量繁殖，從而不易形成致病的環境條件。